Omics Data Engineer (d/w/m)

Ärztlicher Dienst_Kampagne_Nächste Entdeckung

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Arbeitszeit
Vollzeit

Eintrittsdatum
01.03.2025

Dauer der Anstellung
Befristet

Bewerbungsfrist
19.02.2024

Kennziffer
4281

Entgeltgruppe
E13

Unternehmensbeschreibung

Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patient*innen und Bürger*innen zu erreichen. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.

Wir suchen für das Team CUBI-HPC von Prof. Dr. Dieter Beule zum 01.03.2025 befristet bis zum 31.12.2025 eine*n Omics Data Engineer (w/m/d) in Vollzeit (38,5h/Woche).

Die BIH-HPC Unit sucht eine motivierte, detailorientierte Person zur Vertretung. Du bist verantwortlich für die Entwicklung und den Betrieb von Software und Systemen, welche die Datenflüsse und -verarbeitung von Omics-Daten (Genomics, Proteomics, Metabolomics,…) in der translationalen Forschung steuern. Unser Team begeistert sich für effektive und effiziente Datenverarbeitung zur Transformation von Daten in klinisch umsetzbare Ergebnisse. Der/die ideale Kandidat/in ist ein/e Teamplayer/in und besitzt ein umfassendes Verständnis von Omics-Rohdaten, Omics-Datenverarbeitung und DevOps Systembetrieb. Wir sind Teil der relevanten nationalen Forschungsdateninfrastrukturen, insbesondere in NFDI-GHGA und als Genomrechenzentrum (GRZ) im Modellvorhaben Genomsequenzierung. Du wirst in einem internationalen Team in einem modernen Büro in Berlin Mitte arbeiten.

Das erwartet Sie

Entwicklung, Bereitstellung und Wartung von Software und Systemen zur Unterstützung und Automatisierung der Datenflüsse, der Verarbeitung, Speicherung und Organisation von Daten in jedem Schritt des Datenlebenszyklus
Engineering (Entwicklung, Dokumentation, Verbreitung und Verfeinerung) zuverlässiger und konformer Datenflüssen sowie System-Deployment und -Monitoring
Koordination von Projekten mit den datenerzeugenden Facilities, der Core Unit Bioinformatics und den Endnutzern (Medizinische Genetik, Krebszentrum, Pathologie, Forschungsgruppen, ...), Support für Endnutzer, Koordination mit der zentralen IT bzgl. Netzwerk, Firewall und RZ-Themen.
Fehlerbehebung einschließlich Ursachenanalyse von Problemen mit Datenflüssen und Datenverarbeitung, die sich über mehrere Einheiten und Organisationen erstrecken, zusammen mit Teammitgliedern der beteiligten Einheiten

Das bringen Sie mit

MSc in Informatik, Bioinformatik oder gleichwertig, relevante Promotion ist von Vorteil
Detailierte Kenntnisse von Omics-Daten, -Dateiformaten und -Verarbeitung erwünscht
Hervorragende Programmierkenntnisse in Bash und Python notwendig, Erfahrung mit REST-basierten APIs erwünscht
Nachgewiesene Fähigkeit, gut gestalteten und dokumentierten Code zu erstellen, gute Kenntnisse in git, Software-Engineering und Testautomatisierung erforderlich; tiefgreifendes Verständnis von modernem System-Deployment und -Monitoring erwartet.
Erfahrung ceph und openstack notwendig, Erfahrung mit der iRODS ist von Vorteil
Tiefgreifendes Verständnis von Linux/Slurm-Clusterumgebung notwendig, umfassende Erfahrung im Linux-Betreib und
Troubleshooting erforderlich
Erfahrung mit Linux-Netzwerken erforderlich, Erfahrung mit Firewall- und Switch-Konfiguration ist von Vorteil
Teamplayer mit guten Deutsch und Englisch Kenntnissen

Das bieten wir Ihnen

Eine abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsweisenden Forschungsinstitut
Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. Das Jahresgehalt (brutto) ist für eine Vollzeitstelle ohne Sonder- oder Zusatzzahlungen angegeben. Den Tarifvertrag finden Sie hier
Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
Mobiles Bürgeramt vor Ort
Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad
Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin

Wir leben Vielfalt!

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.
Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.

Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über unser Online-Bewerbungsformular mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weitere relevante Anlagen (wie Arbeitgeberzeugnisse, Abschlusszeugnisse etc.) bis zum 19.02.2025 unter Angabe der Kennziffer 4281 ein.

Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden Sie hier.

Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.

Nähere Informationen zum BIH finden Sie hier.

Bewerbung

Unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.

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Ansprechperson

Für fachliche Rückfragen zur Stellenausschreibung steht Ihnen Herr Prof. Dr. Dieter Beule (E-Mail: dieter.beule@bih-charite.de) gerne zur Verfügung.

Vorteile und Leistungen

Faire Löhne und Arbeitskonditionen

An der Charité erwarten dich Tarifverträge mit fairem Gehalt, vielfältigen Zusatzleistungen und 30 Tagen Urlaub. Die aktuellen Tarifverträge und Entgelttabellen findest du hier.

Interdisziplinäres Arbeiten

Wir kooperieren mit anderen Kliniken weltweit und arbeiten auch im Alltag interdisziplinär zusammen. Unsere Arbeit ist geprägt von einem kontinuierlichen Austausch untereinander.

Stimulierendes Arbeitsumfeld

An der Charité arbeiten herausragende Kolleginnen und Kollegen. Ein optimales Umfeld für die eigene Weiterentwicklung.

Weitere Vorteile

Häufig gestellte Fragen

Kann ich Familie und Beruf an der Charité gut vereinen?

Die Charité ist bereits seit 2007 als familienfreundliches Unternehmen zertifiziert. Wir unterstützen Eltern bei regulärer und flexibler Kinderbetreuung, bei der Betreuung in Notfällen, bei Überstunden oder bei Krankheit des Kindes und während der Ferien. Weitere Informationen hierzu gibt es unter familie.charite.de.

Für Mitarbeitende der Gesundheitsfachberufe, die ihre Arbeitszeit verkürzen oder flexibel gestalten wollen, gibt es einen familienfreundlichen Pool.

Gibt es eine Impfpflicht an der Charité?

Das Masernschutzgesetz sieht vor, dass Beschäftigte in medizinischen Einrichtungen einen Masern-Impfschutz bzw. eine Immunität nachweisen. Dabei spielt es keine Rolle, ob sie in der Krankenversorgung oder hinter den Kulissen tätig sind.

Eine COVID-19-Impfung ist keine Einstellungsvoraussetzung.

Gibt es auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten?

Generell bieten wir immer auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten. Ob und in welcher Form besprichst du am besten direkt mit deiner Ansprechpartnerin oder Ansprechpartner.

Weitere Fragen und Antworten

Weitere Informationen

Datenschutzhinweise

Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.

Zusatzinformationen

Die Charité – Universitätsmedizin Berlin trifft ihre Personalentscheidungen nach Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung. Die Charité strebt eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an und fordert Frauen daher nachdrücklich auf, sich zu bewerben. Bei gleichwertiger Qualifikation werden Frauen im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten vorrangig berücksichtigt. Bewerbungen von Menschen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt. Bei der Einstellung wird ein polizeiliches Führungszeugnis, teilweise ein erweitertes Führungszeugnis verlangt. Die Bewerbungsunterlagen können leider nur dann zurückgeschickt werden, wenn ein ausreichend frankierter Rückumschlag beigefügt ist. Eventuell anfallende Reisekosten können nicht erstattet werden.