Arbeiten an der Charité
Die Klinik für Pädiatrische Endokrinologie und Diabetologie der Charité-Universitätsmedizin Berlin (AG Kühnen) sucht zum eine motivierte Doktorandin (PhD) oder einen motivierten Doktoranden (PhD) der Bioinformatik. Der Schwerpunkt der Forschung unserer Gruppe liegt auf seltenen endokrinen und metabolischen Erkrankungen. Insbesondere stehen dabei die Bedeutung epigenetischer Modifikationen für die zentrale Regulation des Körpergewichts und die schilddrüsenhormonvermittelte Regulation der humanen Gehirnentwicklung im Vordergrund. Um die Auswirkungen genetischer und epigenetischer Varianten auf hormonell regulierte molekulare Signalwege zu analysieren, konzentriert sich die translationale Forschung unserer Gruppe auf experimentelle Modelle, die auf humanen, embryonalen Stammzellen (hESC) und humanen, induzierten, pluripotenten Stammzellen (hiPSC) basieren.
Die Stelle im Überblick
Im Mittelpunkt des Projektes steht die Untersuchung der epigenetischen Regulierung des Körpergewichts. Dieses Projekt zielt insbesondere darauf ab, verschiedene Ebenen der epigenetischen Regulation (DNA-Methylierung, Chromatinmarkierungen) und das Zusammenspiel zwischen genetischen und epigenetischen Varianten zu untersuchen. Insbesondere die Identifizierung metastabiler Epiallele, ihre Beziehung zu Transposons und die Auswirkungen von Umweltfaktoren auf die epigenetische Variabilität sind von Bedeutung.
Zu den wichtigsten Aufgaben im Rahmen des Projekts gehören:
- Bioinformatische Analyse komplexer genomweiter Datensätze (neu generiert und öffentlich verfügbar), einschließlich Methylom-, Cut&Tag-, ATAC-seq-, ChIP-seq-, single-cell-/single-nucleus Analysen aus Primärgewebe und aus stammzellbasierten Modellsystemen
- Entwicklung neuer/ innovativer Ansätze für die bioinformatische Analyse
- Verarbeitung großer „Omics“-Datensätze, Identifizierung und effiziente Integration relevanter öffentlicher Ressourcen, Beitrag zur Datenverarbeitung und Automatisierung der Verarbeitung
- Versuchsplanung, Umsetzung biomedizinischer Fragen in bioinformatische Ansätze und Förderung des interdisziplinären Austauschs zwischen biomedizinischen und bioinformatischen Forschenden
Wissenschaftlichen Mitarbeitenden wird nach Maßgabe ihres Dienstverhältnisses ausreichend Zeit zu eigener wissenschaftlicher Arbeit gegeben.
Das bringt die Charité mit
- Eine hoch professionelle Zusammenarbeit in einem motivierten und interdisziplinären Team
- Eine zukunftsorientierte, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit mit hoher Eigenverantwortung und persönlichem Handlungsspielraum
- Interkulturelle Teamveranstaltungen, gut strukturiertes Onboarding mit netten Kolleginnen und Kollegen
- Vergünstigungen bei vielen Angeboten für Beschäftigte für die Bereiche Shopping, Reisen, Sport
- Zusätzliche Absicherung im Alter durch unsere betriebliche Altersvorsorge
- Zertifizierung als familiengerechte Hochschule und familiengerechtes Unternehmen seit 2007 - Hier finden Sie weitere Informationen