Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) Bioinformatik, Schwerpunkt Single Cell & Spatial Omics
Arbeitszeit
Teilzeit, Vollzeit
Eintrittsdatum
01.10.2025
Dauer der Anstellung
Befristet
Bewerbungsfrist
2 Wochen
Einsatzort Charité
BIH Berlin Mitte
Kennziffer
5201
Entgeltgruppe
E13
Unternehmensbeschreibung
Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patient*innen und Bürger*innen zu erreichen. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.
Wir suchen für die AG Roland Eils zum 01.10.2025 befristet bis zum 30.06.2029 eine*n Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) Bioinformatik, Schwerpunkt Single Cell & Spatial Omics in Voll- oder Teilzeit (min. 35,00 h/Woche).
Das BIH-Zentrum für Digitale Gesundheit unter der Leitung von Prof. Roland Eils widmet sich der Förderung innovativer Entwicklungen und Anwendungen in den Lebenswissenschaften und der klinischen Versorgung. Wir vereinen Fachkompetenz in Omics, Bildgebung, Big Data und künstlicher Intelligenz, um Fortschritte in biomedizinischen Bereichen wie Krebs, Stoffwechsel und Immunologie voranzutreiben. Wir engagieren uns in nationalen und internationalen Initiativen, darunter ELIXIR und Human Cell Atlas. Im Transregio-Sonderforschungsbereich 412 untersuchen wir die molekularen und zellulären Determinanten der metabolischen Dysfunktion-assoziierten steatotischen Lebererkrankung (MASLD). Für die Unterstützung von Projekten der Konsortialpartner sowie zur Entwicklung und Anwendung rechnergestützter Methoden zur Analyse großskaliger Omics-Datensätze suchen wir eine*n hochmotivierte*n Postdoktorand*in in der Bioinformatik.
Das erwartet Sie
- Kuratierung und Integration von Einzelzell- und räumlichen Multi-Omics-Daten zur Erstellung eines „Leberzell-Atlas“
- Entwicklung und Koordination bioinformatischer Datenverarbeitungs-Workflows zwischen den Partnern des Konsortiums
- Implementierung und Anwendung von Machine-Learning- und Deep-Learning-Methoden für fortgeschrittene Einzelzell- und räumliche Multi-Omics-Analysen im Bereich der Leberforschung
- Wissenschaftliche Kommunikation, einschließlich Publikationen, Organisation und Durchführung von Workshops sowie Teilnahme an Konferenzen
Das bringen Sie mit
- Promotion (Dr. / PhD) in den Naturwissenschaften, Bioinformatik oder einem vergleichbaren Fachgebiet
- Mindestens 5 Jahre Erfahrung in der Omics-Datenanalyse unter Verwendung einer Programmiersprache wie R, Python, Julia oder vergleichbar
- Erfahrung mit reproduzierbarer Bioinformatik unter Nutzung von Tools wie Git, Conda, Docker o.ä.
- Erfahrung in der Analyse von Einzelzell- und räumlichen Transkriptomik-Daten
- Erfahrung im Einsatz von künstlicher Intelligenz bzw. Machine-Learning-Methoden für die Einzelzell-Omics-Forschung
Das bieten wir Ihnen
- Eine abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsweisenden Forschungsinstitut
- Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. Das Jahresgehalt (brutto) ist für eine Vollzeitstelle ohne Sonder- oder Zusatzzahlungen angegeben. Den Tarifvertrag finden Sie hier.
- Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
- Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
- 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
- Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
- Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
- Mobiles Bürgeramt vor Ort
- Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad
- Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am
Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin
Wir leben Vielfalt!
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.
Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.
Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über unser Online-Bewerbungsformular mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weitere relevante Anlagen (wie Arbeitgeberzeugnisse, Abschlusszeugnisse etc.) bis zum 22.08.2025 unter Angabe der Kennziffer 5201 ein.
Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden Sie hier.
Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.
Nähere Informationen zum BIH finden Sie hier.
Bewerbung
An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.
Jetzt unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.
Jetzt bewerbenAnsprechperson
Für fachliche Rückfragen zur Stellenausschreibung steht Ihnen Herr Naveed Ishaque (naveed.ishaque@bih-charite.de) gerne zur Verfügung.
Weitere Informationen
Datenschutzhinweise
Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.
Zusatzinformationen
Die Charité – Universitätsmedizin Berlin trifft ihre Personalentscheidungen nach Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung. Die Charité strebt eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an und fordert Frauen daher nachdrücklich auf, sich zu bewerben. Bei gleichwertiger Qualifikation werden Frauen im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten vorrangig berücksichtigt. Bewerbungen von Menschen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt. Bei der Einstellung wird ein polizeiliches Führungszeugnis, teilweise ein erweitertes Führungszeugnis verlangt. Die Bewerbungsunterlagen können leider nur dann zurückgeschickt werden, wenn ein ausreichend frankierter Rückumschlag beigefügt ist. Eventuell anfallende Reisekosten können nicht erstattet werden.