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Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter / DoktorandIn (d/w/m)

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Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter / DoktorandIn (d/w/m)

Fachgebiet
Infektiologie, Intensiv- und Notfallmedizin

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Arbeitszeit
Teilzeit

Eintrittsdatum
01.04.2026

Dauer der Anstellung
Befristet

Bewerbungsfrist
28.02.2026

Einsatzort Charité
Campus Virchow-Klinikum, Wedding

Kennziffer
6206

Entgeltgruppe
E13

 

Arbeiten an der Charité

Die Charité – Universitätsmedizin Berlin ist eines der größten und renommiertesten Universitätsklinika Europas und verbindet exzellente Patientenversorgung mit wegweisender biomedizinischer Forschung. An der Schnittstelle von Medizin, Biologie und Datenwissenschaft entwickelt die Charité innovative Ansätze für die Präzisionsmedizin von morgen.

Diese Position ist eingebettet in das neu gegründete Einstein Center for Early Disease Interception (EC-EDI), ein Konsortium führender Berliner Institutionen, darunter die Charité, das Berlin Institute of Health (BIH), das Max-Delbrück-Centrum und die TU Berlin. Die Mission des Zentrums besteht darin, Krankheiten in ihren frühesten Stadien zu diagnostizieren und abzufangen – wenn nur wenige Zellen betroffen sind – unter Einsatz modernster Einzelzell-Technologien, fortschrittlicher KI und von Patienten abgeleiteter Krankheitsmodelle.

Der/Die erfolgreiche Kandidat/in wird gemeinsam mit zwei Forschungsgruppen arbeiten:

Das Buchauer Lab („Systembiologie von Infektionskrankheiten") an der Klinik für Infektiologie der Charité entwickelt computergestützte Methoden zur Entschlüsselung von Immunantworten auf Infektionen und Impfstoffe und kombiniert dabei Einzelzell-Omics-Daten, mathematische Modellierung und maschinelles Lernen.

Das Haas Lab („Systemhämatologie, Stammzellen & Präzisionsmedizin") am BIH/Charité/MDC-BIMSB entwickelt und wendet multimodale Einzelzell- und räumlich aufgelöste Technologien an, um die Krebsentstehung und Immunzell-Interaktionen zu untersuchen. Das Labor hat bahnbrechende Präzisionsdiagnostik-Tools der nächsten Generation auf Basis von Einzelzell-Multi-Omics entwickelt und kürzlich bis zu 50-fach-Vollspektrum-Durchflusszytometrie-Assays mit nahezu Einzelzell-Genomik-Auflösung entwickelt.

Die Stelle im Überblick

Im Rahmen des Einstein Center for Early Disease Interception suchen wir eine/n Doktorand/in zur Entwicklung computergestützter Methoden, die eine schnelle, datengestützte Diagnose von Lungenerkrankungen ermöglichen.

Unser Ziel ist es, ein Framework aufzubauen, das Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten aus Blutproben in interpretierbare Merkmalsvektoren umwandelt und eine auf maschinellem Lernen basierende Klassifizierung von Lungenerkrankungen ermöglicht, darunter virale und bakterielle Infektionen, Autoimmunerkrankungen und Lungenkrebs. Wir streben an, diese von scRNA-seq abgeleiteten Signaturen auf ultra-hochplexe Durchflusszytometrie für den klinischen Einsatz zu übertragen.

 

Ihre Aufgaben:

  • Entwicklung robuster Algorithmen zur batch-korrigierten Integration und Zusammenfassung von scRNA-seq-Datensätzen von >1.000 Patienten
  • Erstellung menschlich interpretierbarer Merkmale (Zelltypproportionen, Genexpressions-Scores), die für Datensatz-übergreifende Stabilität optimiert sind
  • Training und Validierung von Machine-Learning-Klassifikatoren für die Mehrklassen-Diagnose von Lungenerkrankungen
  • Übersetzung von scRNA-seq-abgeleiteten Immunsignaturen in spektrale Durchflusszytometrie-Messungen
  • Zusammenarbeit mit klinischen und experimentellen Partnern innerhalb des EC-EDI-Konsortiums
  • Sie sind wissenschaftlich tätig: Nach § 110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor

Danach suchen wir

Erforderlich:

  • Master-Abschluss in einer quantitativen Disziplin: Physik, Mathematik, Informatik, Statistik, maschinelles Lernen, Data Science oder computational biology/Bioinformatik
  • Ausgeprägte Programmierkenntnisse (z. B. Python und/oder R)
  • Erfahrung mit Methoden des maschinellen Lernens
  • Selbstständige, strukturierte und detailorientierte Arbeitsweise
  • Sehr gute Englischkenntnisse

 

Wünschenswert:

  • Erfahrung in der Analyse hochdimensionaler biomedizinischer Daten (z. B. Omics, Einzelzelldaten)
  • Vertrautheit mit Batch-Korrektur, Dimensionsreduktion oder Methoden zur Integration mehrerer Datensätze
  • Kenntnisse in Software-Engineering-Prinzipien (Versionskontrolle, Testing, Dokumentation)
  • Interesse an translationaler Forschung und klinischer Anwendung

Wir suchen eine neugierige, eigeninitiative Person, die Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit hat und motiviert ist, computergestützte Fortschritte in die klinische Praxis zu übertragen.

Das bringt die Charité mit

  • Mitwirkung in einem hochkarätigen, interdisziplinären Forschungskonsortium (Einstein Center for Early Disease Interception) mit direkter klinischer Auswirkung

  • Gemeinsame Betreuung durch zwei führende Einzelzell- und Computational-Biology-Labore

  • Hochprofessionelles Arbeitsumfeld in motivierten und interdisziplinären Teams

  • Zugang zu einzigartigen klinischen Datensätzen und moderner Recheninfrastruktur an der Charité, am BIH und am MDC-BIMSB

  • Strukturiertes Promotionsprogramm mit Möglichkeiten zur wissenschaftlichen Weiterbildung und Karriereentwicklung

  • Kollaboratives, internationales Arbeitsumfeld im Herzen des Berliner biomedizinischen Forschungsökosystems mit interkulturellen Teamevents und einer gut strukturierten Einarbeitungsphase mit hilfsbereiten Teammitgliedern

  • Umfangreiche Angebote für interne Schulungen und berufliche Weiterentwicklung sowie Weiterqualifizierung

  • Arbeitsplatz am Charité Campus Virchow-Klinikum, gut mit öffentlichen Verkehrsmitteln erreichbar

  • Sonderangebote in den Bereichen Einkaufen, Reisen und Sport

Informationen zur Stelle

  • Entgeltgruppe E13 TVöD. Hier finden Sie alle Informationen zum Gehalt und Tarifvertrag
  • Arbeitszeit: Teilzeitbeschäftigung in Höhe von  65 % (25,03 WoStd.)
  • Die Position ist ab 01.04.2026  bis zum 31.12.2028 befristet, da sie an die Projektlaufzeit gebunden ist
  • Bei uns sind 30 Tage Urlaub Standard
  • Die Bewerbungsfrist endet am: 28.02.2026
  • Kennziffer: 6206

Bewerbung

 

An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.

Jetzt unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.

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Bei Fragen wenden Sie sich bitte an:

Prof. Dr. Lisa Buchauer, lisa.buchauer@charite

Vorteile und Leistungen

Faire Löhne und Arbeitskonditionen

An der Charité erwarten dich Tarifverträge mit fairem Gehalt, vielfältigen Zusatzleistungen und 30 Tagen Urlaub. Die aktuellen Tarifverträge und Entgelttabellen findest du hier

Interdisziplinäres Arbeiten

Wir kooperieren mit anderen Kliniken weltweit und arbeiten auch im Alltag interdisziplinär zusammen. Unsere Arbeit ist geprägt von einem kontinuierlichen Austausch untereinander. 

Stimulierendes Arbeitsumfeld

An der Charité arbeiten herausragende Kolleginnen und Kollegen. Ein optimales Umfeld für die eigene Weiterentwicklung. 

Häufig gestellte Fragen

Kann ich Familie und Beruf an der Charité gut vereinen?

Die Charité ist bereits seit 2007 als familienfreundliches Unternehmen zertifiziert. Wir unterstützen Eltern bei regulärer und flexibler Kinderbetreuung, bei der Betreuung in Notfällen, bei Überstunden oder bei Krankheit des Kindes und während der Ferien. Weitere Informationen hierzu gibt es unter familie.charite.de.

Für Mitarbeitende der Gesundheitsfachberufe, die ihre Arbeitszeit verkürzen oder flexibel gestalten wollen, gibt es einen familienfreundlichen Pool

 

Gibt es eine Impfpflicht an der Charité?

Das Masernschutzgesetz sieht vor, dass Beschäftigte in medizinischen Einrichtungen einen Masern-Impfschutz bzw. eine Immunität nachweisen. Dabei spielt es keine Rolle, ob sie in der Krankenversorgung oder hinter den Kulissen tätig sind.

Eine COVID-19-Impfung ist keine Einstellungsvoraussetzung.

 

Gibt es auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten?

Generell bieten wir immer auch die Möglichkeit, in Teilzeit zu arbeiten. Ob und in welcher Form besprichst du am besten direkt mit deiner Ansprechpartnerin oder Ansprechpartner.

 

Weitere Informationen

Datenschutzhinweise

Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.

Zusatzinformationen

Die Charité – Universitätsmedizin Berlin trifft ihre Personalentscheidungen nach Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung. Die Charité strebt eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an und fordert Frauen daher nachdrücklich auf, sich zu bewerben. Bei gleichwertiger Qualifikation werden Frauen im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten vorrangig berücksichtigt. Bewerbungen von Menschen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt. Bei der Einstellung wird ein polizeiliches Führungszeugnis, teilweise ein erweitertes Führungszeugnis verlangt. Die Bewerbungsunterlagen können leider nur dann zurückgeschickt werden, wenn ein ausreichend frankierter Rückumschlag beigefügt ist. Eventuell anfallende Reisekosten können nicht erstattet werden.