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Informatikerin/ Informatiker (d/w/m) Data Engineering & Data Science in der Krebsmedizin

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Informatikerin/ Informatiker (d/w/m) Data Engineering & Data Science in der Krebsmedizin

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Arbeitszeit
Vollzeit, Teilzeit

Eintrittsdatum
Ab sofort

Dauer der Anstellung
Befristet

Bewerbungsfrist
16.03.2026

Einsatzort Charité
BIH Berlin Mitte

Kennziffer
6125

Entgeltgruppe
E13

 

Unternehmensbeschreibung

Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patient*innen und Bürger*innen zu erreichen. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.

Wir suchen im Rahmen des Nationalen Centrums für Tumorerkrankungen (NCT) am Standort Berlin zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet für 2 Jahre eine*n Informatikerin/ Informatiker (d/w/m) Data Engineering & Data Science in der Krebsmedizin in Teil- oder Vollzeit (min. 30,00h/Woche).


Sie übernehmen eine verantwortungsvolle und vielseitige Aufgabe im Rahmen des Studienprogramms des Nationalen Centrums für Tumorerkrankungen (NCT). Das NCT ist eine langfristige Kooperation zwischen dem Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) und exzellenten Partnern der Universitätsmedizin und Forschung. Ziel ist es, vielversprechende Ergebnisse aus der Krebsforschung schnell und sicher in die klinische Anwendung zu bringen. Das NCT Berlin wird eng mit dem bestehenden Berliner Standort des Deutschen Konsortiums für Translationale Krebsforschung (DKTK) und dem Medizinischen Datenintegrationszentrum (MeDIC) der Charité zusammenarbeiten.

Das erwartet Sie

Im Rahmen Ihrer Tätigkeit leisten sie einen wichtigen Beitrag zur Nutzbarmachung medizinischer Routinedaten für die Krebsforschung. In einem interdisziplinären Team designen und implementieren Sie Lösungen zur Überführung von lokalen Daten aus Klinikinformationssystemen, Registern oder Studiensystemen in die nationale Forschungsdatenplattform des NCT. Diese Position wird zeitgleich mit einer weiteren Stelle, angesiedelt am Charité Comprehensive Cancer Center, besetzt. Eine enge Zusammenarbeit dieser beiden Positionen ist Voraussetzung für den Erfolg der IT Strukturen des NCT sowohl am Standort Berlin als auch im NCT.


Ihr Aufgabengebiet umfasst insbesondere:
• Mitarbeit in einem interdisziplinären und lokal sowie standortübergreifend vernetzten Team aus Informatiker:innen, Mediziner:innen und weiterem Fachpersonal.
• Design und Implementierung von Konzepten zur standortübergreifenden Integration und Zusammenführung von komplexen medizinischen Daten aus verschiedenen Routine- und Forschungssystemen.
• Aufbau eines NCT-Datenmodells und eines Kerndatensatzes für die nationale Forschungsplattform unter Berücksichtigung des MII-Kerndatensatzes auf Basis von HL7 FHIR und Terminologien wie SNOMED CT.
• Erschließung lokaler Datenquellen sowie Pflege bestehender Schnittstellen inklusive Transformation proprietärer Datenformate in das NCT-Datenmodell unter Nutzung moderner Big-Data-Infrastrukturen.

Das bringen Sie mit

• Erfolgreich abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder vergleichbar) der Informatik oder einer vergleichbaren Fachrichtung (z. B. Medizininformatik oder Bioinformatik) 
• Solides Datenbanken- und Data Science-Know-How sowie Kenntnisse beim Aufbau von ETL/ELT-Strecken mit Spark und NiFi inklusive damit verbundener Aspekte wie Automatisierung und Qualitätssicherung sowie Erfahrungen mit in diesem Umfeld gängigen Programmier- und Abfragesprachen (u.a. SQL, Scala, Java, Python, R) sind wünschenswert.
• Erfahrungen in der verteilten Verarbeitung von Daten auf einem Rechencluster, Cloud-orientierten Betriebsmodellen und Technologien wie Kubernetes, Apache Spark oder Ansible sind von Vorteil.
• Idealerwiese haben Sie ein tiefgreifendes Verständnis von medizinischen Datenmodellen und Interoperabilitätsstandards, wie HL7 FHIR, SNOMED CT, LOINC oder OpenEHR.
• Erfahrungen im Bereich der Onkologie von Vorteil.
• Sehr gute Kommunikations- und Organisationsfähigkeiten.
• Gute Deutschkenntnisse.
• Selbstständige, zuverlässige und effiziente Arbeitsweise.
• Ausgeprägte Sozial- und Teamkompetenz, Fähigkeit zu priorisieren.

Das bieten wir Ihnen

  • Gestaltungsspielraum in einem anspruchsvollen, abwechslungsreichen, internationalen und freundlichen Arbeitsumfeld in einem zukunftsweisenden Forschungsfeld
  • Die Möglichkeit, wichtige Beiträge zur datengetriebenen und patientenzentrierten Krebsmedizin zu leisten
  • Schnelle Übernahme von Verantwortung in einem stetig wachsenden Team
  • Ein modernes Büro im Herzen von Berlin
  • Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. 
  • Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
  • Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
  • 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
  • Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben, Freizeit und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
  • Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
  • Mobiles Bürgeramt vor Ort
  • Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad

 

Wir leben Vielfalt!

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.
Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.

Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über unser Online-Bewerbungsformular mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weitere relevante Anlagen (wie Arbeitgeberzeugnisse, Abschlusszeugnisse etc.) ein.

Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden Sie hier.

Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.

Nähere Informationen zum BIH finden Sie hier.

Bewerbung

 

An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.

Jetzt unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.

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Ansprechperson

Für fachliche Rückfragen zur Stellenausschreibung steht Ihnen Herr Prof. Fabian Prasser (E-Mail: fabian.prasser@bih-charite.de) gerne zur Verfügung.

Fragen rund um den Bewerbungsprozess richten Sie gerne per E-Mail an jobs@bih-charite.de

Weitere Informationen

Datenschutzhinweise

Die Charité weist darauf hin, dass im Rahmen und zu Zwecken des Bewerbungsverfahrens an verschiedenen Stellen in der Charité (z.B. Fachbereich, Personalvertretung, Personalabteilung) personenbezogene Daten gespeichert und verarbeitet werden. Weiterhin können die Daten innerhalb des Konzerns sowie an Stellen außerhalb (z.B. Behörden) zur Wahrung berechtigter Interessen übermittelt bzw. verarbeitet werden. Mit Ihrer Bewerbung stimmen Sie unseren Datenschutz- und Nutzungsbestimmungen für Bewerbungsverfahren, die Sie hier finden, zu.

Zusatzinformationen

Die Charité – Universitätsmedizin Berlin trifft ihre Personalentscheidungen nach Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung. Die Charité strebt eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an und fordert Frauen daher nachdrücklich auf, sich zu bewerben. Bei gleichwertiger Qualifikation werden Frauen im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten vorrangig berücksichtigt. Bewerbungen von Menschen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt. Bei der Einstellung wird ein polizeiliches Führungszeugnis, teilweise ein erweitertes Führungszeugnis verlangt. Die Bewerbungsunterlagen können leider nur dann zurückgeschickt werden, wenn ein ausreichend frankierter Rückumschlag beigefügt ist. Eventuell anfallende Reisekosten können nicht erstattet werden.